76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0259 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0259  protein of unknown function DUF554  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0274  protein of unknown function DUF554  97.37 
 
 		 228 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.637934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0758  hypothetical protein  63.11 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4952  protein of unknown function DUF554  51.1 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000963174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3319  hypothetical protein  49.78 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0507  hypothetical protein  49.32 
 
 		 231 aa  204  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23500  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  47.11 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000125984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0848  hypothetical protein  48.03 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2254  protein of unknown function DUF554  47.47 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.376452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1541  protein of unknown function DUF554  46.85 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.766682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2621  protein of unknown function DUF554  46.58 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3423  protein of unknown function DUF554  44.8 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2488  hypothetical protein  45.95 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000155229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2513  hypothetical protein  45.78 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0134252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1714  hypothetical protein  41.92 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1697  hypothetical protein  41.45 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1894  hypothetical protein  41.03 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1672  hypothetical protein  41.03 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1720  hypothetical protein  41.03 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1856  hypothetical protein  41.03 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3485  hypothetical protein  41.13 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1857  hypothetical protein  41.05 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1448  hypothetical protein  42.36 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0567223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3049  protein of unknown function DUF554  43.24 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.076823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1972  hypothetical protein  40.61 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2939  protein of unknown function DUF554  44.39 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1941  hypothetical protein  40.69 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1184  hypothetical protein  44.59 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0168554  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1507  protein of unknown function DUF554  44.44 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.749554  normal  0.0994454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1140  hypothetical protein  41.06 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2831  protein of unknown function DUF554  41.71 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0947  protein of unknown function DUF554  33.64 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0469  hypothetical protein  40.09 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000429599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1278  hypothetical protein  41.9 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.856375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0575  hypothetical protein  41.18 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.942908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1389  hypothetical protein  44.14 
 
 		 232 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0722  hypothetical protein  36.53 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0698  hypothetical protein  36.53 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1691  protein of unknown function DUF554  40.18 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3009  hypothetical protein  39 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1536  hypothetical protein  42.72 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2078  protein of unknown function DUF554  34.21 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2324  hypothetical protein  41.49 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0811  hypothetical protein  35.09 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1187  hypothetical protein  40.16 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.724078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0371  hypothetical protein  40.58 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1628  protein of unknown function DUF554  43.57 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2145  protein of unknown function DUF554  34.96 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2283  hypothetical protein  38.86 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.452521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1546  protein of unknown function DUF554  42.32 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3832  hypothetical protein  38.89 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000789065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00110  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  34.75 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3280  YqgA  33.04 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3357  hypothetical protein  33.04 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.930348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3460  hypothetical protein  33.04 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3365  hypothetical protein  33.04 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  0.509414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3291  YqgA  33.04 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0471  protein of unknown function DUF554  29.57 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20890  uncharacterized membrane protein, possible Na+ channel or pump  35 
 
 		 275 aa  98.6  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1312  hypothetical protein  37.55 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1160  protein of unknown function DUF554  30.87 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3381  hypothetical protein  34.78 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4001 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0492  protein of unknown function DUF554  27.07 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.1131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3084  protein of unknown function DUF554  29.57 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00111761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2899  protein of unknown function DUF554  28.88 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000109146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1252  hypothetical protein  28.99 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000565892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2560  protein of unknown function DUF554  28.82 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000206819  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4270  hypothetical protein  31.46 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.268165  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0729  protein of unknown function DUF554  31.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02796  predicted inner membrane protein  31.46 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00140908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02759  hypothetical protein  31.46 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00129663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0748  hypothetical protein  31.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3127  hypothetical protein  31.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3312  hypothetical protein  31.46 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3401  hypothetical protein  31.46 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.403767  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3019  hypothetical protein  31.3 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>