49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55080  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  unclonable  3.46847e-21 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31500  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.93 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1928  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.16 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.4 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0429  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.16 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000348661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1869  exodeoxyribonuclease VII  29.46 
 
 		 530 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.205151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  31.58 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.48 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0823  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.54 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.62 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.19 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0178  exodeoxyribonuclease VII  28.68 
 
 		 526 aa  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.33 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8274  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.56 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.31 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20410  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.63 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.586183  normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.65 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  31 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.83 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000660487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2324  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.21 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.975786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4107  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.122512 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.57 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0367  exonuclease VII, large subunit  39.47 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11130  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.68 
 
 		 432 aa  46.6  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.76 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.06 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1678  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.99 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.08 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4633  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12180  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  28.97 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  28.42 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3609  Exonuclease VII, large subunit  42.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0011411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.27 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0236  Exodeoxyribonuclease VII  29.27 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2077  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.14 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172367  normal  0.206552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.68 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  40.58 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  31.94 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0127  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.29 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.27 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000422836  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3116  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.78 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.51 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  27.59 
 
 		 449 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  32.58 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1074  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.78 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>