161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3609 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3609  Exonuclease VII, large subunit  100 
 
 
305 aa  595  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0011411  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1237  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.21 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1031  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.75 
 
 
394 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1280  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.58 
 
 
458 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.320775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1979  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.86 
 
 
414 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.337025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0529  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.44 
 
 
419 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2085  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.84 
 
 
465 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1293  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.74 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0968  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.54 
 
 
421 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.315378  hitchhiker  0.000127982 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0029  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.86 
 
 
388 aa  52.8  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0282686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3009  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.17 
 
 
472 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2759  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.07 
 
 
443 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.340088  normal  0.610939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2006  exodeoxyribonuclease VII large subunit  49.25 
 
 
444 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3105  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.43 
 
 
475 aa  52.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1351  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36 
 
 
387 aa  52.4  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.65 
 
 
445 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.65 
 
 
445 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000193789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.11 
 
 
453 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3490  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.2 
 
 
476 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.655561  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22970  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  36 
 
 
479 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.776819  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0056  putative exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.86 
 
 
388 aa  50.4  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4389  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.62 
 
 
432 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1893  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  32.5 
 
 
424 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.185054 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0255  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.29 
 
 
387 aa  49.7  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182071  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0347  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.33 
 
 
387 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0939  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.92 
 
 
456 aa  49.7  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0421457  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1675  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40 
 
 
387 aa  49.7  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1101  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.89 
 
 
432 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0370  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.33 
 
 
387 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.284967  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00415  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.54 
 
 
445 aa  49.3  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3117  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.21 
 
 
424 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000975107  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0281  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.62 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.396563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1818  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.47 
 
 
467 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4592  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.71 
 
 
459 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0171  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.29 
 
 
453 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5539  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.06 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1446  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.24 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1259  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.24 
 
 
463 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0368  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.33 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313066 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1034  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.61 
 
 
476 aa  47.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.31032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3498  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.89 
 
 
526 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1634  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.718824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1006  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  47.37 
 
 
406 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3067  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.9 
 
 
402 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6807  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.12 
 
 
501 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0976698  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.63 
 
 
422 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000320124  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02381  exonuclease VII, large subunit  40.28 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0878  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.44 
 
 
417 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.78 
 
 
453 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0712  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.67 
 
 
511 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1188  Exodeoxyribonuclease VII  30.83 
 
 
529 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0154172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0764  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.67 
 
 
511 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130053  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0681  exodeoxyribonuclease VII large subunit  39.71 
 
 
416 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0718  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.67 
 
 
448 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
449 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1017  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.53 
 
 
398 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
449 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0198  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.82 
 
 
555 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
449 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000699903  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2727  exodeoxyribonuclease 7 large subunit  36.25 
 
 
523 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0564335  normal  0.143765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
449 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1761  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  40.58 
 
 
455 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.84 
 
 
449 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000015005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.7 
 
 
454 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000169842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4197  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.75 
 
 
463 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.76 
 
 
445 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.83026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39770  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.18 
 
 
456 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.979844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.57 
 
 
446 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000027114  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0846  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.55 
 
 
401 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2550  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30 
 
 
448 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000306428 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  26.8 
 
 
406 aa  46.2  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16320  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.19 
 
 
437 aa  45.8  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8482  Exodeoxyribonuclease VII  47.37 
 
 
402 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0952  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.26 
 
 
496 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0727  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  44.44 
 
 
420 aa  45.8  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0605  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.45 
 
 
516 aa  45.4  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0262  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.89 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.94 
 
 
401 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0916  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.77 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0119351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0268  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.93 
 
 
384 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2078  exodeoxyribonuclease VII large subunit  24.3 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0122  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  29.91 
 
 
511 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2482  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.48 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.780603  normal  0.458338 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1183  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.33 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0612657  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0641  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  27.66 
 
 
449 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.782635  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26430  Exodeoxyribonuclease VII large subunit  30.4 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0524422  normal  0.366699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.03 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2413  exodeoxyribonuclease VII large subunit  40.58 
 
 
402 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2553  exodeoxyribonuclease VII large subunit  41.43 
 
 
541 aa  44.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.30129  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1915  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  30.65 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15230  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.63 
 
 
459 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173867  hitchhiker  0.000000000874033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55080  hypothetical protein  42.19 
 
 
401 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  unclonable  3.46847e-21 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1037  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  25.4 
 
 
397 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0524439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.95 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1056  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  33.78 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1339  exodeoxyribonuclease VII large subunit  29.63 
 
 
462 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
456 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
458 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000130865  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01051  exodeoxyribonuclease VII  41.38 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125237  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.53 
 
 
456 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000633307  normal  0.0126087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>