More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_22550 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_22550  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000168449  hitchhiker  0.000023534 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0607  LysR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 310 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.822767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0547  LysR family substrate binding transcriptional regulator  61.3 
 
 		 318 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2618  putative HTH-type transcriptional regulator YafC  59 
 
 		 314 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 304 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  36.47 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  36.47 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 315 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 313 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 334 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 334 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 334 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 334 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  34.12 
 
 		 315 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0850  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.840067  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 324 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  30.8 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  37.35 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  34.4 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3953  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  35.04 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  34.65 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>