More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25391 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  978    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.96 
 
 		 489 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.5 
 
 		 467 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.52 
 
 		 477 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.79 
 
 		 467 aa  728    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.41 
 
 		 474 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.92 
 
 		 467 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.51 
 
 		 465 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.89 
 
 		 471 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.25 
 
 		 474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  57.05 
 
 		 452 aa  531  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.77 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.67 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  52.9 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  52.9 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.27 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.84 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.83 
 
 		 460 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.53 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.74 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.89 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.31 
 
 		 438 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.31 
 
 		 438 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.1 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 		 446 aa  300  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.25 
 
 		 434 aa  299  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.62 
 
 		 438 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  39.32 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.13 
 
 		 438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.75 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 		 434 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  38.56 
 
 		 434 aa  285  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.5 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  38.03 
 
 		 439 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.11 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  37.92 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  37.05 
 
 		 442 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.78 
 
 		 437 aa  281  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  39.5 
 
 		 447 aa  279  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  39.08 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  38.87 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 		 463 aa  277  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.03 
 
 		 440 aa  277  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  36.42 
 
 		 441 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.97 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  35.58 
 
 		 438 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.3 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.23 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.14 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.28 
 
 		 467 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.56 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.76 
 
 		 436 aa  269  7e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.58 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  39.24 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.27 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  36.74 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.21 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.96 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.21 
 
 		 473 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  37.21 
 
 		 473 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  36.51 
 
 		 470 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  38.99 
 
 		 435 aa  266  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  36.94 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  35.91 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.63 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.83 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.49 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  35.67 
 
 		 463 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 		 459 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.31 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.27 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  36.91 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.38 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.21 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.83 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  36.83 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.83 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  34.75 
 
 		 427 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  38.28 
 
 		 473 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.93 
 
 		 450 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  36.85 
 
 		 445 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.08 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.14 
 
 		 482 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.61 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  36.17 
 
 		 482 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.38 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  35.83 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  35.98 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.19 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.03 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.98 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.5 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 		 470 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.91 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  34.9 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>