More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0190 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.74 
 
 		 467 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.74 
 
 		 467 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.83 
 
 		 489 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76 
 
 		 477 aa  743    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 467 aa  954    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.53 
 
 		 474 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.79 
 
 		 482 aa  728    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.44 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.14 
 
 		 471 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.94 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  57.76 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  55.15 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  55.15 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  54.41 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.43 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.98 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.44 
 
 		 475 aa  500  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.56 
 
 		 434 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.87 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.65 
 
 		 438 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.78 
 
 		 433 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.13 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.43 
 
 		 438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.56 
 
 		 434 aa  299  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.91 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  37.8 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  36.73 
 
 		 446 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.22 
 
 		 456 aa  292  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  39.09 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.48 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.42 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.93 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  37.37 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.31 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.31 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.38 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.44 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  38.01 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  39.35 
 
 		 463 aa  279  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  39.35 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  38.88 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.77 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.54 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  37.8 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  38.88 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.88 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  37.04 
 
 		 466 aa  276  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.88 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.71 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.21 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.83 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.59 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.12 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.12 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  37.01 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.61 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  37.01 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.07 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  36.85 
 
 		 439 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  34.84 
 
 		 427 aa  269  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.7 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.01 
 
 		 433 aa  269  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.54 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  40.04 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.55 
 
 		 460 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  36.5 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  36.54 
 
 		 473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.32 
 
 		 473 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  38.41 
 
 		 473 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.8 
 
 		 437 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.48 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.22 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.44 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  35.65 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  36.42 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.52 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  35.01 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  36.27 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.68 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  34.26 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.74 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.02 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.02 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  36.02 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  36.58 
 
 		 470 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  34.74 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  36.08 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.58 
 
 		 433 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  36.4 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  31.68 
 
 		 440 aa  260  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  37.77 
 
 		 435 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.9 
 
 		 439 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  33.56 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.36 
 
 		 470 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  35.94 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  36.61 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>