More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0358 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.78 
 
 
464 aa  738    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  954    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  62.91 
 
 
452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.52 
 
 
475 aa  590  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.43 
 
 
468 aa  578  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  59.83 
 
 
471 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  59.83 
 
 
471 aa  566  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.09 
 
 
477 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.41 
 
 
467 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.41 
 
 
489 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.67 
 
 
482 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.51 
 
 
460 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.98 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.98 
 
 
467 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.48 
 
 
465 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.17 
 
 
471 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.45 
 
 
474 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.83 
 
 
474 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.31 
 
 
438 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.65 
 
 
440 aa  300  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  36.82 
 
 
446 aa  299  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.26 
 
 
434 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  37.88 
 
 
434 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  37.88 
 
 
434 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  37.18 
 
 
434 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  36.8 
 
 
433 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  37.34 
 
 
438 aa  285  8e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  37.88 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.69 
 
 
440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  35.85 
 
 
456 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  37.55 
 
 
442 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.58 
 
 
438 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.28 
 
 
442 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  37.04 
 
 
439 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  37.12 
 
 
434 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  36.42 
 
 
441 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.04 
 
 
438 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.33 
 
 
451 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  37.12 
 
 
434 aa  280  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  35.59 
 
 
440 aa  280  5e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  36.54 
 
 
466 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  35.04 
 
 
445 aa  279  9e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 
444 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  36.56 
 
 
447 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.91 
 
 
443 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.06 
 
 
460 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  35.79 
 
 
440 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.98 
 
 
445 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.17 
 
 
436 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  36.12 
 
 
449 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  36.12 
 
 
449 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.93 
 
 
445 aa  276  7e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.77 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  38.49 
 
 
440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.7 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.9 
 
 
453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.74 
 
 
437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 
449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  35.95 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  35.95 
 
 
435 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  36.44 
 
 
435 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.13 
 
 
442 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 
438 aa  272  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  34.41 
 
 
464 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.65 
 
 
438 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  35.64 
 
 
452 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.8 
 
 
438 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  35.03 
 
 
463 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  35.11 
 
 
457 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  36.13 
 
 
482 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.15 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.92 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  35.5 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.23 
 
 
436 aa  270  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.13 
 
 
482 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.29 
 
 
450 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  35.76 
 
 
445 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.48 
 
 
445 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.66 
 
 
467 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.82 
 
 
457 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  34.42 
 
 
463 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.61 
 
 
467 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.97 
 
 
457 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.81 
 
 
472 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  36.15 
 
 
453 aa  266  7e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.13 
 
 
470 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.09 
 
 
435 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  36.91 
 
 
440 aa  266  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  36.27 
 
 
440 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.5 
 
 
434 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  35.91 
 
 
470 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.15 
 
 
433 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.42 
 
 
436 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.88 
 
 
433 aa  265  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.92 
 
 
436 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>