More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13901 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  963    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.41 
 
 
467 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.62 
 
 
467 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.55 
 
 
489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.13 
 
 
477 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.94 
 
 
467 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.25 
 
 
482 aa  594  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.03 
 
 
474 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.93 
 
 
465 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.05 
 
 
471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  53.3 
 
 
452 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.83 
 
 
463 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.05 
 
 
464 aa  490  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  50.74 
 
 
471 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  50.74 
 
 
471 aa  481  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.05 
 
 
468 aa  476  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.36 
 
 
475 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.76 
 
 
438 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  35.56 
 
 
434 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  35.48 
 
 
438 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  35.34 
 
 
438 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 
434 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  35.27 
 
 
456 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  35.13 
 
 
433 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  35.13 
 
 
434 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  34.7 
 
 
438 aa  290  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  34.39 
 
 
440 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  35.46 
 
 
434 aa  285  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  35.61 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  35.46 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.74 
 
 
437 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.7 
 
 
438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  36.09 
 
 
438 aa  283  7.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.62 
 
 
443 aa  282  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.11 
 
 
436 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.34 
 
 
434 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  35.55 
 
 
435 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 
441 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  34.11 
 
 
482 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  34.26 
 
 
439 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.41 
 
 
434 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.33 
 
 
436 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  34.75 
 
 
441 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  34.12 
 
 
436 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  34.12 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  34.12 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.26 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  34.48 
 
 
446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.97 
 
 
482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  34.55 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.18 
 
 
438 aa  273  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.37 
 
 
460 aa  272  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  34.91 
 
 
452 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  33.4 
 
 
466 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.9 
 
 
439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.98 
 
 
433 aa  269  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.7 
 
 
473 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.08 
 
 
450 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  35.12 
 
 
440 aa  268  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.6 
 
 
434 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.62 
 
 
438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.42 
 
 
451 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.76 
 
 
438 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.42 
 
 
473 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  32.49 
 
 
476 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.42 
 
 
473 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.33 
 
 
442 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  32.42 
 
 
473 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.81 
 
 
434 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  32.98 
 
 
467 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.41 
 
 
433 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  33.62 
 
 
470 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  32.78 
 
 
457 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.63 
 
 
470 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.38 
 
 
453 aa  260  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.32 
 
 
436 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  34.25 
 
 
454 aa  259  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.62 
 
 
445 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.12 
 
 
438 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.99 
 
 
467 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.14 
 
 
457 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  32.35 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.35 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.29 
 
 
459 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.35 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  34.96 
 
 
453 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  35.99 
 
 
427 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.83 
 
 
442 aa  257  3e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  34.05 
 
 
459 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  33.33 
 
 
440 aa  256  6e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.79 
 
 
467 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  31.33 
 
 
437 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.97 
 
 
437 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.6 
 
 
436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  32.56 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  31.33 
 
 
437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.63 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.4 
 
 
454 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.56 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>