More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06460 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
468 aa  965    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  62.85 
 
 
471 aa  592  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  62.85 
 
 
471 aa  592  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  60.43 
 
 
463 aa  578  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  60.75 
 
 
452 aa  577  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.75 
 
 
464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.41 
 
 
475 aa  569  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.42 
 
 
477 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.98 
 
 
467 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.58 
 
 
467 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.24 
 
 
465 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.58 
 
 
467 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.27 
 
 
482 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.12 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.46 
 
 
471 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.1 
 
 
489 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.8 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.05 
 
 
474 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  35.93 
 
 
446 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.79 
 
 
438 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.91 
 
 
457 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.47 
 
 
438 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  34.91 
 
 
466 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  36.89 
 
 
467 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 
438 aa  278  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.94 
 
 
467 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 
434 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  36.48 
 
 
454 aa  276  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  35.82 
 
 
454 aa  276  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  37.17 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  35.19 
 
 
470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.24 
 
 
434 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  36.11 
 
 
456 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  35.89 
 
 
433 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  34.27 
 
 
440 aa  271  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  36.11 
 
 
438 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  36.11 
 
 
438 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.79 
 
 
440 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  36.32 
 
 
434 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  36.32 
 
 
434 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.43 
 
 
482 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  35.89 
 
 
427 aa  266  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.7 
 
 
443 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.93 
 
 
442 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  35.08 
 
 
440 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  35 
 
 
482 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  34.93 
 
 
442 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  34.5 
 
 
441 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.72 
 
 
470 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  37.24 
 
 
447 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.62 
 
 
466 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.84 
 
 
442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.19 
 
 
451 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.28 
 
 
457 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.64 
 
 
457 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.89 
 
 
466 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.43 
 
 
473 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.5 
 
 
470 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.43 
 
 
473 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.26 
 
 
447 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.43 
 
 
473 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  36.38 
 
 
452 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  36.07 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  35.43 
 
 
473 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  36.07 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.07 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  34.99 
 
 
453 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.07 
 
 
470 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.52 
 
 
453 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  32.9 
 
 
445 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  35.1 
 
 
473 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.03 
 
 
450 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  35.36 
 
 
439 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.52 
 
 
434 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  35.85 
 
 
454 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  35.01 
 
 
434 aa  257  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.97 
 
 
445 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  36.23 
 
 
470 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.2 
 
 
457 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  35.28 
 
 
459 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  33.91 
 
 
441 aa  256  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  35.01 
 
 
434 aa  256  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  35.06 
 
 
435 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.62 
 
 
466 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  34.62 
 
 
466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.82 
 
 
438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.59 
 
 
436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  35.29 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  34.19 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  34.19 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.19 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.19 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  35.59 
 
 
436 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  34.71 
 
 
441 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  33.12 
 
 
449 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  33.77 
 
 
441 aa  254  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  35.59 
 
 
435 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  34.92 
 
 
440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.83 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  34.27 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>