More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13173 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  74.78 
 
 
463 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
464 aa  961    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.52 
 
 
475 aa  597  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  62.75 
 
 
452 aa  591  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.75 
 
 
468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  59.23 
 
 
471 aa  569  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  59.23 
 
 
471 aa  569  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.56 
 
 
460 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.43 
 
 
467 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.77 
 
 
482 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.63 
 
 
477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.3 
 
 
489 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.92 
 
 
467 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.32 
 
 
471 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.71 
 
 
467 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.01 
 
 
474 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.07 
 
 
465 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.05 
 
 
474 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.83 
 
 
438 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  37.04 
 
 
454 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.83 
 
 
454 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
439 aa  279  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
433 aa  279  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.82 
 
 
453 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.92 
 
 
450 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  36.5 
 
 
438 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  36.74 
 
 
443 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  37.2 
 
 
440 aa  277  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 
438 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 
438 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  37.15 
 
 
434 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 
445 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  36.93 
 
 
438 aa  276  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  36.58 
 
 
434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  36.11 
 
 
444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.82 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 
442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  36.99 
 
 
434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  34.13 
 
 
446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  36.99 
 
 
434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  36.72 
 
 
434 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  36.77 
 
 
440 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.42 
 
 
434 aa  273  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.42 
 
 
437 aa  273  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  36.77 
 
 
441 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 
441 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  36.96 
 
 
440 aa  272  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.71 
 
 
438 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  36.97 
 
 
445 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.19 
 
 
473 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.01 
 
 
436 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.19 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  35.9 
 
 
456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.48 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  35.19 
 
 
473 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  36.01 
 
 
436 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.05 
 
 
442 aa  269  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  36.01 
 
 
435 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.84 
 
 
451 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  36.75 
 
 
454 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.47 
 
 
467 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.82 
 
 
457 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  35.84 
 
 
454 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.19 
 
 
445 aa  268  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  35.03 
 
 
453 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  35.55 
 
 
466 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.62 
 
 
482 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  35.04 
 
 
482 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  34.19 
 
 
476 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 
440 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.33 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.68 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.68 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  35.68 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.27 
 
 
442 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.85 
 
 
438 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  35.68 
 
 
470 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  34.68 
 
 
470 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.68 
 
 
470 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.12 
 
 
457 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  35.38 
 
 
449 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  34.4 
 
 
445 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.68 
 
 
470 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  36.4 
 
 
447 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  34.7 
 
 
440 aa  265  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.42 
 
 
444 aa  264  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  35.47 
 
 
470 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.41 
 
 
464 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.55 
 
 
445 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 
453 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.55 
 
 
446 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.31 
 
 
466 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.96 
 
 
427 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.38 
 
 
434 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.82 
 
 
466 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  33.62 
 
 
467 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.69 
 
 
440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  36.21 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  34.91 
 
 
475 aa  259  6e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 
446 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>