More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1279 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
460 aa  944    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  58.67 
 
 
452 aa  537  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.66 
 
 
475 aa  536  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  56.19 
 
 
471 aa  528  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  56.19 
 
 
471 aa  528  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.56 
 
 
464 aa  531  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.51 
 
 
463 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.12 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 
467 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.65 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.83 
 
 
482 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.56 
 
 
465 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.32 
 
 
477 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.74 
 
 
489 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
474 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.81 
 
 
467 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.81 
 
 
467 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.3 
 
 
474 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.96 
 
 
438 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  41.2 
 
 
433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 
440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  40.22 
 
 
447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
434 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.93 
 
 
438 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.93 
 
 
438 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
434 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.76 
 
 
434 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.4 
 
 
438 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  40.04 
 
 
466 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.17 
 
 
438 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 
434 aa  299  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  38.67 
 
 
435 aa  299  6e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
452 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  39.69 
 
 
456 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.24 
 
 
436 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  41.24 
 
 
436 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  41.24 
 
 
435 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.18 
 
 
473 aa  295  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  39.15 
 
 
440 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.18 
 
 
473 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  38.18 
 
 
473 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  38.7 
 
 
434 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  39.29 
 
 
441 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  37.17 
 
 
482 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.98 
 
 
443 aa  293  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  38.7 
 
 
434 aa  293  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.96 
 
 
482 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  38.56 
 
 
450 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
463 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  38.5 
 
 
440 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  38.62 
 
 
442 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  38.56 
 
 
450 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.35 
 
 
478 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.33 
 
 
427 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.17 
 
 
454 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.79 
 
 
450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  39.47 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  37.12 
 
 
476 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  38.39 
 
 
441 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.77 
 
 
473 aa  289  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  38.04 
 
 
470 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  38.67 
 
 
439 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.9 
 
 
460 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  37.92 
 
 
446 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.04 
 
 
470 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.12 
 
 
466 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.04 
 
 
470 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.07 
 
 
472 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.96 
 
 
503 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 
438 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  37.86 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  37.83 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  37.86 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  37.12 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  35.91 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.83 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  35.48 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.53 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  37.12 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  39.02 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  39.02 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.25 
 
 
437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 
434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.86 
 
 
452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  36.7 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 
445 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.39 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  38.6 
 
 
440 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  37.72 
 
 
440 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.28 
 
 
451 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  36.2 
 
 
440 aa  281  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  37.83 
 
 
470 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  37.77 
 
 
466 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.61 
 
 
457 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.77 
 
 
466 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.77 
 
 
466 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  38.76 
 
 
450 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  36.3 
 
 
454 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  36.97 
 
 
466 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.44 
 
 
442 aa  280  4e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>