More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2734 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2734  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
452 aa  919    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18745  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.52 
 
 
475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0358  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.91 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.75 
 
 
464 aa  591  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06460  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.75 
 
 
468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29766  predicted protein  59.6 
 
 
471 aa  555  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0025927  hitchhiker  0.00128965 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27143  predicted protein  59.6 
 
 
471 aa  555  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538639  normal  0.201769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1279  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.67 
 
 
460 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0190  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.76 
 
 
467 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107102  normal  0.0279515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14211  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.99 
 
 
465 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.462031  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25391  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.05 
 
 
482 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0222  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.02 
 
 
477 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03421  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.95 
 
 
489 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06831  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.6 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0865822  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0062  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.6 
 
 
467 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1312  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.61 
 
 
474 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277728  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.3 
 
 
474 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.99611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13981  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.54 
 
 
471 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 
438 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.97 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 
434 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
438 aa  306  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
438 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 
438 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.31 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.97 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.17 
 
 
482 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 
447 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.95 
 
 
440 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  38.56 
 
 
441 aa  296  6e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.48 
 
 
436 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.74 
 
 
445 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  38.34 
 
 
438 aa  294  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
456 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  39.39 
 
 
436 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  39.39 
 
 
435 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
440 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.65 
 
 
438 aa  293  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  39.52 
 
 
482 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.34 
 
 
438 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 
440 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.07 
 
 
442 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
452 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.8 
 
 
443 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  38.99 
 
 
434 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  38.99 
 
 
434 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  37.99 
 
 
440 aa  290  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  39.87 
 
 
463 aa  289  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  38.63 
 
 
441 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  38.55 
 
 
446 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 
437 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.09 
 
 
445 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.91 
 
 
442 aa  287  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.77 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.21 
 
 
436 aa  286  7e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  38.73 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.32 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.47 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.56 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.23 
 
 
457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.99 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.19 
 
 
453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.46 
 
 
466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  37.23 
 
 
466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.19 
 
 
452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  36.4 
 
 
454 aa  283  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  37.72 
 
 
476 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  37.58 
 
 
445 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  38.99 
 
 
439 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.5 
 
 
454 aa  282  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  38.13 
 
 
446 aa  282  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.56 
 
 
442 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 
440 aa  281  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  38.97 
 
 
466 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.61 
 
 
447 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.63 
 
 
466 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.95 
 
 
438 aa  280  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  38.6 
 
 
435 aa  280  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  36.92 
 
 
437 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 
443 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  36.92 
 
 
437 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  38.18 
 
 
445 aa  279  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.84 
 
 
466 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.84 
 
 
466 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.12 
 
 
467 aa  279  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.96 
 
 
440 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 
453 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.93 
 
 
470 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.04 
 
 
450 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.43 
 
 
438 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  36.26 
 
 
438 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  38.63 
 
 
466 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  37.72 
 
 
470 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.23 
 
 
457 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  36.91 
 
 
467 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>