More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4427 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4427  alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 		 566 aa  1165    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.826704  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  51.5 
 
 		 570 aa  561  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  49.02 
 
 		 570 aa  550  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  51.85 
 
 		 567 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0543  alpha-glucan phosphorylase  49.91 
 
 		 578 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2997  glycogen phosphorylase  48.75 
 
 		 558 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00491814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2234  alpha-glucan phosphorylases  47.86 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3640  phosphorylase  45.81 
 
 		 558 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.373302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3890  alpha-glucan phosphorylases  47.09 
 
 		 563 aa  462  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  44.94 
 
 		 538 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1065  alpha-glucan phosphorylase  41.2 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00035073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  45.41 
 
 		 693 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  41.16 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  40.22 
 
 		 854 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  39.1 
 
 		 855 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  41.13 
 
 		 854 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  40.48 
 
 		 854 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  39.12 
 
 		 862 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  37.7 
 
 		 855 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  40.78 
 
 		 854 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  38.36 
 
 		 853 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  41.06 
 
 		 832 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  38.25 
 
 		 844 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  40.03 
 
 		 716 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  40.19 
 
 		 856 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  39.84 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  39.29 
 
 		 861 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  40.06 
 
 		 854 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  40.39 
 
 		 854 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  38.09 
 
 		 712 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  38.13 
 
 		 823 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  38.25 
 
 		 737 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  39.13 
 
 		 736 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  38.68 
 
 		 853 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  40.36 
 
 		 850 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  40.84 
 
 		 850 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  39.48 
 
 		 722 aa  363  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  39.52 
 
 		 854 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  39.48 
 
 		 719 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  39.45 
 
 		 854 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  37.92 
 
 		 1413 aa  360  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  39.84 
 
 		 855 aa  359  6e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  38.13 
 
 		 703 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  39.12 
 
 		 847 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  39.48 
 
 		 842 aa  358  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  37.88 
 
 		 703 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  37.52 
 
 		 717 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  39.13 
 
 		 838 aa  355  8.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  37.12 
 
 		 849 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  38.81 
 
 		 854 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  37.6 
 
 		 706 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  37.39 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  38.58 
 
 		 706 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  38.32 
 
 		 690 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  38.51 
 
 		 705 aa  349  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  37.8 
 
 		 852 aa  346  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  37.99 
 
 		 849 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  37.94 
 
 		 713 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  36.38 
 
 		 545 aa  340  5e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  37.3 
 
 		 704 aa  339  8e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  36.68 
 
 		 535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  37.4 
 
 		 863 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  37.81 
 
 		 694 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  37.39 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1811  alpha-glucan phosphorylases  37.3 
 
 		 862 aa  332  8e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  39.52 
 
 		 875 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  37.87 
 
 		 849 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  38.6 
 
 		 863 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  36.08 
 
 		 737 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  36.69 
 
 		 748 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  37.7 
 
 		 857 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3895  Alpha-glucan phosphorylase  37.24 
 
 		 713 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  34.72 
 
 		 729 aa  327  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0582  Alpha-glucan phosphorylase  37.92 
 
 		 856 aa  326  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  35.75 
 
 		 719 aa  325  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  36.81 
 
 		 541 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  38.22 
 
 		 873 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  37.38 
 
 		 860 aa  323  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  37.48 
 
 		 853 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1109  alpha-glucan phosphorylases  38.61 
 
 		 851 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.407099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  36.89 
 
 		 854 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  37.4 
 
 		 852 aa  320  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1436  alpha-glucan phosphorylase  38.41 
 
 		 850 aa  319  7.999999999999999e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.702483  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0621  alpha-glucan phosphorylase  38.21 
 
 		 858 aa  318  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0956  alpha-glucan phosphorylases  38.52 
 
 		 852 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.631272  normal  0.360082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  37.26 
 
 		 855 aa  316  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  37.79 
 
 		 835 aa  316  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  35.7 
 
 		 875 aa  316  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  35.39 
 
 		 850 aa  316  7e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  36.01 
 
 		 850 aa  312  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  36.55 
 
 		 871 aa  311  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  36.82 
 
 		 851 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_002950  PG0699  maltodextrin phosphorylase  36.17 
 
 		 856 aa  310  5e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000863488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  36.21 
 
 		 872 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  37.28 
 
 		 881 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  36.64 
 
 		 849 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  36.88 
 
 		 841 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  35.74 
 
 		 858 aa  307  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  36.88 
 
 		 841 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  36.88 
 
 		 877 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>