More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3664 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  62.19 
 
 
855 aa  1050    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  61.38 
 
 
851 aa  982    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  45.33 
 
 
854 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  59.33 
 
 
863 aa  993    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  67.33 
 
 
863 aa  1116    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  61.32 
 
 
857 aa  1003    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  46.36 
 
 
850 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  61.83 
 
 
873 aa  1015    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  44.08 
 
 
862 aa  697    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3064  alpha-glucan phosphorylase  57.01 
 
 
822 aa  847    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  43.31 
 
 
854 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  38.88 
 
 
855 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  62.62 
 
 
835 aa  1024    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  44.56 
 
 
854 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  42.42 
 
 
854 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  57.18 
 
 
849 aa  924    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  60.42 
 
 
860 aa  1013    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  44.48 
 
 
854 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 
852 aa  1704    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  58.79 
 
 
875 aa  989    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  64.29 
 
 
858 aa  1038    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  37.83 
 
 
853 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  85.6 
 
 
854 aa  1466    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  41.89 
 
 
854 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  60.3 
 
 
860 aa  1011    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  40.54 
 
 
849 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  40.58 
 
 
853 aa  675    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  59.39 
 
 
877 aa  996    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  65.11 
 
 
849 aa  1105    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  43.16 
 
 
856 aa  647    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  45.45 
 
 
854 aa  702    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  45.73 
 
 
854 aa  720    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1098  alpha-glucan phosphorylase  59.58 
 
 
856 aa  915    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.27206  hitchhiker  0.000386148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  65.38 
 
 
863 aa  1083    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  58.74 
 
 
872 aa  1000    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  66.82 
 
 
860 aa  1127    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  46.24 
 
 
850 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  63.09 
 
 
875 aa  1075    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  50.69 
 
 
853 aa  791    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  44.35 
 
 
854 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  61.33 
 
 
871 aa  1015    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1811  alpha-glucan phosphorylases  62.41 
 
 
862 aa  1041    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  60.3 
 
 
860 aa  1011    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  59.5 
 
 
881 aa  992    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  42.81 
 
 
855 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  43.7 
 
 
861 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  38.92 
 
 
848 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  38.45 
 
 
849 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  37.85 
 
 
855 aa  625  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  42.79 
 
 
832 aa  624  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  41.63 
 
 
858 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  45.74 
 
 
690 aa  622  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  41.94 
 
 
850 aa  618  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  40.12 
 
 
1421 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  41.42 
 
 
842 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  38.08 
 
 
1413 aa  602  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  39.16 
 
 
847 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  41.05 
 
 
838 aa  595  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  43.76 
 
 
716 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  37.5 
 
 
850 aa  590  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0582  Alpha-glucan phosphorylase  40.95 
 
 
856 aa  582  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  44.21 
 
 
719 aa  579  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  44.77 
 
 
722 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  42.5 
 
 
712 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  43.53 
 
 
748 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  37.78 
 
 
852 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  39.81 
 
 
823 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0699  maltodextrin phosphorylase  38.92 
 
 
856 aa  555  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000863488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  42.44 
 
 
737 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  41.97 
 
 
719 aa  556  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  42.7 
 
 
736 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  38.87 
 
 
844 aa  552  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  40.25 
 
 
705 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  40.28 
 
 
704 aa  545  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0941  glycogen phosphorylase family protein  43.38 
 
 
833 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.893354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  39.42 
 
 
729 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  39.35 
 
 
703 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  42.63 
 
 
841 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0621  alpha-glucan phosphorylase  38.26 
 
 
858 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  42.63 
 
 
841 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  39.58 
 
 
706 aa  535  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  40.67 
 
 
717 aa  534  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  38.81 
 
 
703 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0956  alpha-glucan phosphorylases  38.74 
 
 
852 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.631272  normal  0.360082 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  41.65 
 
 
713 aa  528  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  39.01 
 
 
706 aa  529  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1109  alpha-glucan phosphorylases  41.18 
 
 
851 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.407099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  40.36 
 
 
737 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1436  alpha-glucan phosphorylase  38.66 
 
 
850 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.702483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  44.84 
 
 
693 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  41.96 
 
 
694 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1428  alpha-glucan phosphorylase  38.94 
 
 
834 aa  509  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3895  Alpha-glucan phosphorylase  41.38 
 
 
713 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  38.1 
 
 
540 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  38.98 
 
 
538 aa  369  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  35.48 
 
 
570 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  37.38 
 
 
541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  37.89 
 
 
545 aa  354  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  36.81 
 
 
541 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  37.21 
 
 
535 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>