More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0371 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  44.52 
 
 		 855 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  51.11 
 
 		 861 aa  897    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  44.16 
 
 		 855 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  39.88 
 
 		 1413 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  100 
 
 		 854 aa  1753    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  43.18 
 
 		 841 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  45.4 
 
 		 849 aa  766    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  50.07 
 
 		 736 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  48.35 
 
 		 858 aa  803    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  45.1 
 
 		 849 aa  754    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  45.51 
 
 		 854 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  51.55 
 
 		 719 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  45.17 
 
 		 863 aa  709    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1098  alpha-glucan phosphorylase  43.6 
 
 		 856 aa  638    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.27206  hitchhiker  0.000386148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0582  Alpha-glucan phosphorylase  40.72 
 
 		 856 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  44.96 
 
 		 873 aa  687    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  49.35 
 
 		 712 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  49.86 
 
 		 716 aa  717    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  46.76 
 
 		 713 aa  663    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  68.62 
 
 		 854 aa  1244    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  49.72 
 
 		 737 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  51.12 
 
 		 854 aa  881    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  43.73 
 
 		 850 aa  758    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  42.77 
 
 		 823 aa  649    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  66.98 
 
 		 850 aa  1180    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  42.87 
 
 		 844 aa  653    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  49.76 
 
 		 854 aa  864    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  82.32 
 
 		 854 aa  1478    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  48.47 
 
 		 854 aa  824    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  44.44 
 
 		 832 aa  688    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  41.57 
 
 		 863 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  72.37 
 
 		 854 aa  1307    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  43.93 
 
 		 850 aa  751    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  42.17 
 
 		 852 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  44.96 
 
 		 855 aa  799    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  49.47 
 
 		 854 aa  817    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  45.31 
 
 		 847 aa  725    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  45.33 
 
 		 852 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  48 
 
 		 862 aa  820    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  46.61 
 
 		 703 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  47.3 
 
 		 748 aa  657    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  44.56 
 
 		 851 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  66.39 
 
 		 850 aa  1169    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  44.66 
 
 		 871 aa  707    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  52.23 
 
 		 853 aa  932    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  41.23 
 
 		 860 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  43.48 
 
 		 857 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  45.29 
 
 		 842 aa  711    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  41.35 
 
 		 860 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  49 
 
 		 856 aa  813    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  45.27 
 
 		 863 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  43.87 
 
 		 838 aa  686    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  43.39 
 
 		 849 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  43.18 
 
 		 841 aa  642    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  40.84 
 
 		 875 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  44.17 
 
 		 860 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  42.6 
 
 		 877 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  52.51 
 
 		 690 aa  724    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  44.42 
 
 		 835 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  44.29 
 
 		 848 aa  753    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  42.71 
 
 		 853 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  42.62 
 
 		 1421 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  45.73 
 
 		 875 aa  711    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  70.73 
 
 		 854 aa  1238    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  44.24 
 
 		 849 aa  666    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1811  alpha-glucan phosphorylases  44.6 
 
 		 862 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  51.13 
 
 		 722 aa  719    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  41.35 
 
 		 860 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  42.02 
 
 		 881 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1436  alpha-glucan phosphorylase  41.85 
 
 		 850 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.702483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  48.29 
 
 		 855 aa  815    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  44.07 
 
 		 853 aa  776    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  45.39 
 
 		 858 aa  681    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  45.26 
 
 		 706 aa  635  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  41.3 
 
 		 872 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  45.25 
 
 		 703 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  45.23 
 
 		 737 aa  626  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  46.3 
 
 		 704 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_002950  PG0699  maltodextrin phosphorylase  40.1 
 
 		 856 aa  617  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000863488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0941  glycogen phosphorylase family protein  44.12 
 
 		 833 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.893354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  44.51 
 
 		 729 aa  617  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  47.98 
 
 		 693 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0956  alpha-glucan phosphorylases  40.92 
 
 		 852 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.631272  normal  0.360082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  44.01 
 
 		 717 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  44.57 
 
 		 706 aa  610  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  43.5 
 
 		 705 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0621  alpha-glucan phosphorylase  39.65 
 
 		 858 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  43.32 
 
 		 719 aa  597  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1109  alpha-glucan phosphorylases  40.37 
 
 		 851 aa  598  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.407099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3064  alpha-glucan phosphorylase  43.37 
 
 		 822 aa  585  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  44.46 
 
 		 694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1428  alpha-glucan phosphorylase  38.97 
 
 		 834 aa  557  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3895  Alpha-glucan phosphorylase  42.57 
 
 		 713 aa  542  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  41.48 
 
 		 535 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  43.87 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  43.27 
 
 		 567 aa  405  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  39.74 
 
 		 540 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  39.84 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  42.46 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  38.56 
 
 		 570 aa  399  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>