More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2215 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  41.34 
 
 
858 aa  688    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  49.47 
 
 
855 aa  891    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  45.49 
 
 
713 aa  677    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  50.71 
 
 
712 aa  764    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  44.07 
 
 
854 aa  776    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  45.72 
 
 
848 aa  803    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0699  maltodextrin phosphorylase  39.05 
 
 
856 aa  659    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000863488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  66.12 
 
 
855 aa  1205    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  51.42 
 
 
722 aa  768    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  41.28 
 
 
823 aa  664    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  41.74 
 
 
850 aa  664    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0582  Alpha-glucan phosphorylase  39.51 
 
 
856 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  39.79 
 
 
854 aa  682    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  44.9 
 
 
853 aa  767    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  38.67 
 
 
1421 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  46.66 
 
 
737 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  40.42 
 
 
854 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  43.54 
 
 
854 aa  761    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 
853 aa  1769    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  44.05 
 
 
854 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  41.18 
 
 
854 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  42.61 
 
 
854 aa  750    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  40.19 
 
 
852 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  37.89 
 
 
849 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  42.94 
 
 
854 aa  736    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0621  alpha-glucan phosphorylase  40.35 
 
 
858 aa  670    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  44.18 
 
 
729 aa  636    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  43.43 
 
 
850 aa  743    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  42.57 
 
 
862 aa  730    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  51.42 
 
 
719 aa  783    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  40.33 
 
 
861 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  43.72 
 
 
719 aa  644    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  45.66 
 
 
847 aa  790    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  46.96 
 
 
748 aa  671    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  44.08 
 
 
842 aa  769    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  43.1 
 
 
693 aa  636    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  40.14 
 
 
838 aa  685    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  47.21 
 
 
690 aa  671    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  41.88 
 
 
856 aa  703    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  47.61 
 
 
736 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  45.96 
 
 
849 aa  827    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0956  alpha-glucan phosphorylases  39.25 
 
 
852 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.631272  normal  0.360082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  41.8 
 
 
832 aa  713    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  48.2 
 
 
849 aa  825    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  43.54 
 
 
850 aa  748    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  42.89 
 
 
844 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  40.24 
 
 
1413 aa  681    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  41.29 
 
 
855 aa  698    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  43.31 
 
 
854 aa  746    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  51.34 
 
 
716 aa  771    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  37.92 
 
 
850 aa  652    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1436  alpha-glucan phosphorylase  39.27 
 
 
850 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.702483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  45.92 
 
 
704 aa  631  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  37.73 
 
 
863 aa  632  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  36.83 
 
 
860 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  44.33 
 
 
706 aa  625  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  37.18 
 
 
854 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  37.83 
 
 
852 aa  623  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  37.16 
 
 
875 aa  622  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  44.76 
 
 
703 aa  621  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1109  alpha-glucan phosphorylases  37.35 
 
 
851 aa  617  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.407099  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  37.37 
 
 
863 aa  616  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  37.22 
 
 
877 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  36.4 
 
 
863 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  44.11 
 
 
706 aa  611  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  43.2 
 
 
705 aa  609  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  37.24 
 
 
860 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  42.62 
 
 
717 aa  610  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  36.89 
 
 
860 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  36.69 
 
 
857 aa  606  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  36.89 
 
 
860 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  43.99 
 
 
703 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1811  alpha-glucan phosphorylases  35.49 
 
 
862 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  35.62 
 
 
855 aa  601  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  42.25 
 
 
737 aa  601  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  37.01 
 
 
835 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  36.78 
 
 
881 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  37.9 
 
 
873 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  38.7 
 
 
849 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  35.72 
 
 
872 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  34.56 
 
 
871 aa  589  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  36.06 
 
 
858 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  35.49 
 
 
875 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1098  alpha-glucan phosphorylase  35.27 
 
 
856 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.27206  hitchhiker  0.000386148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  36.66 
 
 
851 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  36.38 
 
 
841 aa  571  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  36.38 
 
 
841 aa  571  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  41.61 
 
 
694 aa  566  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  36.75 
 
 
853 aa  567  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0941  glycogen phosphorylase family protein  35.49 
 
 
833 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.893354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1428  alpha-glucan phosphorylase  35.25 
 
 
834 aa  529  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3895  Alpha-glucan phosphorylase  36.34 
 
 
713 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3064  alpha-glucan phosphorylase  34.79 
 
 
822 aa  506  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  40.7 
 
 
540 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  39.42 
 
 
570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  38.37 
 
 
570 aa  402  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  38.86 
 
 
541 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  36.03 
 
 
545 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  38.54 
 
 
541 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  39.07 
 
 
535 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>