More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0534 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  56.89 
 
 
570 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1163    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  51.76 
 
 
570 aa  619  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3890  alpha-glucan phosphorylases  54.88 
 
 
563 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2997  glycogen phosphorylase  53.26 
 
 
558 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00491814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3640  phosphorylase  50.35 
 
 
558 aa  578  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.373302  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2234  alpha-glucan phosphorylases  52.39 
 
 
561 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0543  alpha-glucan phosphorylase  50 
 
 
578 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4427  alpha-glucan phosphorylase  52.56 
 
 
566 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.826704  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1065  alpha-glucan phosphorylase  42.23 
 
 
559 aa  460  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00035073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  45.24 
 
 
538 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  43.27 
 
 
854 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  41.4 
 
 
737 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  40.56 
 
 
844 aa  412  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  40.74 
 
 
736 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  42.44 
 
 
854 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  40.52 
 
 
716 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  43.97 
 
 
693 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  39.46 
 
 
823 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  37.99 
 
 
855 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  41.91 
 
 
854 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  37.56 
 
 
855 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  39.25 
 
 
713 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  40.39 
 
 
540 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  40.03 
 
 
854 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  41.46 
 
 
854 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  40.88 
 
 
832 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  41.4 
 
 
854 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  40.26 
 
 
712 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  39.55 
 
 
854 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  40.45 
 
 
854 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  39.14 
 
 
862 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  40.68 
 
 
856 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  36.87 
 
 
853 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  39.41 
 
 
853 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  38.26 
 
 
848 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  40.03 
 
 
861 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  38.42 
 
 
748 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  39.4 
 
 
535 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  37.84 
 
 
703 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  40.58 
 
 
850 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  39.26 
 
 
541 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  39.32 
 
 
858 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  40.58 
 
 
850 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  37.78 
 
 
706 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  40.13 
 
 
690 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  37.05 
 
 
703 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  40.1 
 
 
855 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  39.97 
 
 
719 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  40.87 
 
 
854 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  38.13 
 
 
842 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  37.3 
 
 
849 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  38.51 
 
 
717 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  38.44 
 
 
838 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  36.67 
 
 
704 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  37.54 
 
 
541 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  36.14 
 
 
729 aa  363  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  38.98 
 
 
722 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  36.86 
 
 
705 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  37.34 
 
 
706 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  37.32 
 
 
850 aa  361  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  36.41 
 
 
719 aa  359  7e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  37.79 
 
 
737 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  36.44 
 
 
847 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  37.89 
 
 
694 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  37.76 
 
 
841 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  37.76 
 
 
841 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  38.31 
 
 
1421 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  38.47 
 
 
863 aa  353  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  35.91 
 
 
1413 aa  353  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1109  alpha-glucan phosphorylases  39.81 
 
 
851 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.407099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  38.35 
 
 
849 aa  352  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  36.88 
 
 
852 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0680  alpha-glucan phosphorylases  38.8 
 
 
875 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  36.5 
 
 
849 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  38.51 
 
 
858 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  37.28 
 
 
877 aa  350  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  37.52 
 
 
849 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0699  maltodextrin phosphorylase  37.84 
 
 
856 aa  345  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000863488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  38.5 
 
 
873 aa  345  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  37.18 
 
 
860 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  38.06 
 
 
852 aa  343  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  37.48 
 
 
854 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  38.13 
 
 
863 aa  340  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  35.45 
 
 
545 aa  339  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0956  alpha-glucan phosphorylases  37.66 
 
 
852 aa  339  9e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.631272  normal  0.360082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3895  Alpha-glucan phosphorylase  37.54 
 
 
713 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  37.4 
 
 
860 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  37.4 
 
 
860 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  37.4 
 
 
860 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  37.75 
 
 
835 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  37.74 
 
 
855 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  37.84 
 
 
857 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  37.36 
 
 
853 aa  335  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  36.59 
 
 
872 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  37.3 
 
 
851 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  35.86 
 
 
875 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1811  alpha-glucan phosphorylases  38.81 
 
 
862 aa  333  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  36.96 
 
 
881 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  36.55 
 
 
863 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>