123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0908 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 343 aa  85.9  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.67 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  30.27 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  26.76 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  29.03 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.95 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  27.47 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  24.06 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  29.39 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  26.97 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  25.83 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  29.15 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  27.03 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  26.56 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.53 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  25.09 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.95 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.72 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  26.43 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  23.95 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.23 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  25.97 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  27.37 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  24.32 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  24.19 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  26.82 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  26.85 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  24.22 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  24.46 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  24.46 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  24.46 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  24.46 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  25.28 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  29.74 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  24.22 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  24.45 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  24.46 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.76 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  23.55 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  27.41 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  25.87 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  23.79 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  23.55 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  27.19 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  23.79 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  24.85 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  23.69 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  28.04 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25.23 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  32.7 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  23.29 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  24.16 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  24.84 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.39 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  23.55 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  25.88 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  23.25 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.42 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  26.58 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  25.82 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  25.24 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  26.73 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  28.89 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  22.94 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  26.54 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  22.74 
 
 		 288 aa  49.7  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  25 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  29.34 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17940  membrane protein  24.62 
 
 		 512 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>