61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17940  membrane protein  100 
 
 		 512 aa  1028    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  27.55 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  27.55 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  27.42 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  27.7 
 
 		 295 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  27.36 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1877  hypothetical protein  36.43 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.744382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0371  protein of unknown function DUF1393  31.85 
 
 		 276 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0008  hypothetical protein  49.18 
 
 		 185 aa  68.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  24.36 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  25.58 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  26.36 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  27.85 
 
 		 307 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  27.31 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0227  hypothetical protein  32.54 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  26.43 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  26.43 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  26.43 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  22.71 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  24.34 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  23.73 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.04 
 
 		 298 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  23.38 
 
 		 308 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  22.47 
 
 		 323 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  22.91 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  22.91 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.92 
 
 		 289 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  22.61 
 
 		 307 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  22.91 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  22.91 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  22.91 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  22.91 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  26.34 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.87 
 
 		 294 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  23 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0709  hypothetical protein  26.79 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.479249  normal  0.0247628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 296 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  22.77 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  22.44 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  22.11 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  22.44 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  22.44 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  21.85 
 
 		 303 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  22.11 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  22.77 
 
 		 301 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  24.5 
 
 		 293 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 300 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 		 343 aa  47.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  21.78 
 
 		 303 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  26.16 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0908  hypothetical protein  24.43 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  23.95 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 297 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  23.75 
 
 		 295 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.07 
 
 		 293 aa  43.5  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>