50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1416 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  31.05 
 
 
216 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  28.32 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  29.96 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  24.88 
 
 
214 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  28.37 
 
 
209 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  29.73 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  30.1 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  26.91 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  27.8 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  26.03 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  25.79 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  29.26 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.7 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.7 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  26.11 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  23.96 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  26.9 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1315  type IV pilus assembly PilZ  25.98 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00287797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  25.11 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  22.73 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  23.53 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  24.66 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  25.17 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  24.67 
 
 
310 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  24.48 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  22.01 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0636  type IV pilus assembly PilZ  27.78 
 
 
201 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  23.42 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  23.61 
 
 
314 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  23.08 
 
 
317 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  18.63 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1312  type IV pilus assembly PilZ  22.66 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.244718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  26.02 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  23.84 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1111  hypothetical protein  31.15 
 
 
106 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2090  hypothetical protein  24.83 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3334  hypothetical protein  24.83 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5312  YcgR  27.54 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0472  YcgR protein superfamily protein  24.83 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3003  hypothetical protein  24.83 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0275  hypothetical protein  24.83 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0287  hypothetical protein  24.83 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3345  hypothetical protein  24.83 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2894  type IV pilus assembly PilZ  24.66 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.893186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3011  YcgR family protein  30.61 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0249  YcgR protein superfamily protein  24.83 
 
 
252 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  20.73 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2926  YcgR family protein  29.8 
 
 
251 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3061  YcgR family protein  29.8 
 
 
251 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>