24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0459 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  63.81 
 
 		 267 aa  341  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  43.19 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  27.31 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  26.91 
 
 		 381 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  27.84 
 
 		 330 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  26.3 
 
 		 331 aa  92  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  25.71 
 
 		 351 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  28.74 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  27.99 
 
 		 329 aa  85.5  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  28.62 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  28.34 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  25.68 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  25.3 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  26.59 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  23.04 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  27.05 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  22.73 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  21.67 
 
 		 366 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  23.78 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  25.87 
 
 		 209 aa  48.9  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  24.22 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2147  hypothetical protein  24.71 
 
 		 160 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>