16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1109 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1108  hypothetical protein  32.52 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0636  type IV pilus assembly PilZ  28 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  26.62 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  22.6 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1947  type IV pilus assembly PilZ  35.16 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  23.98 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  29.47 
 
 		 250 aa  45.4  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  29.29 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  23.84 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  21.03 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  25.37 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 329 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  26.09 
 
 		 259 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  20.97 
 
 		 224 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>