36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0488 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  31.37 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  28.32 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  29.73 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  27 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  30.43 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1315  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00287797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  27.72 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  26.11 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  25.38 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  26.64 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  27.05 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  30.91 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  23.77 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  31.63 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  21.76 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  30.61 
 
 		 329 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  23.08 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  23.08 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  25.83 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  20.88 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  32.93 
 
 		 330 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  18.32 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1065  type IV pilus assembly PilZ  27.34 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  21.88 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0197  type IV pilus assembly PilZ  26.46 
 
 		 353 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  22.52 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  26.47 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  24.89 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  20.97 
 
 		 251 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  29.35 
 
 		 381 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0465  D-alanine--D-alanine ligase  25.64 
 
 		 313 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0490  D-alanine--D-alanine ligase  25.64 
 
 		 313 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>