23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16650 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  31.05 
 
 
225 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  29.03 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  30.43 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  27.16 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  29.53 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  23.47 
 
 
219 aa  62  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  25.89 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  25.58 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  27.32 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1315  type IV pilus assembly PilZ  23.39 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00287797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  30.77 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.64 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.64 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  19.62 
 
 
253 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  25.33 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1312  type IV pilus assembly PilZ  22.83 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.244718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  26.06 
 
 
219 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  24.65 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  25.49 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  27.07 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0636  type IV pilus assembly PilZ  30.7 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.18 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>