17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2173 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
230 aa  474  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  60 
 
 
222 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  26.34 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  26.39 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  27.4 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  28.5 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  25.11 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  27.32 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  24.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  24.46 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  22.84 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  26.98 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  26.15 
 
 
228 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  27.03 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>