26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2389 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 221 aa  453  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  32.72 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  31.16 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  29.73 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  25.81 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  26.34 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  26.34 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  29.44 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  27.03 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  27.03 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  25.66 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  26.17 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1434  type IV pilus assembly PilZ  24.63 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  26.15 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  25.89 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1315  type IV pilus assembly PilZ  23.98 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00287797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0636  type IV pilus assembly PilZ  31.82 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  24.79 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  23.77 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  24.88 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  23.61 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  22.22 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  21.54 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0197  type IV pilus assembly PilZ  23.3 
 
 		 353 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  25.53 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  23.81 
 
 		 309 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>