15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2692 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
253 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  27.72 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  26.23 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  23.96 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  23.04 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  22.8 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  24.79 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  23.81 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  19.62 
 
 
216 aa  52  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  35.29 
 
 
242 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  21.18 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  21.18 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  36.47 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0380  type IV pilus assembly PilZ  21.22 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>