15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0451 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
222 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2173  type IV pilus assembly PilZ  60 
 
 
230 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0287147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2389  type IV pilus assembly PilZ  26.34 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  26.19 
 
 
218 aa  61.6  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  23.53 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  25.85 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  22.42 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.09 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000212001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0022  type IV pilus assembly PilZ  26.09 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0197  type IV pilus assembly PilZ  26.87 
 
 
353 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1947  type IV pilus assembly PilZ  30.69 
 
 
197 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16650  type IV pilus assembly PilZ  27.07 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  26.46 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  35.11 
 
 
308 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.219768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>