25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3033 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  63.81 
 
 		 259 aa  341  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  39.31 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  26.76 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  28.24 
 
 		 330 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  26.05 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  25.47 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  26.47 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  26.3 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  22.34 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  23.26 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  25.38 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  21.83 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  22.9 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2692  type IV pilus assembly PilZ  22.8 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  21.93 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  28.03 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  22.6 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  24.24 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  19.39 
 
 		 366 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2147  hypothetical protein  29.41 
 
 		 160 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.271808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  18.63 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2150  type IV pilus assembly PilZ  21.79 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0793  glycosyltransferase-like  28.32 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0542127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>