11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1947 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1947  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  28.96 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1109  hypothetical protein  35.16 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1948  hypothetical protein  25.71 
 
 		 521 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  29.69 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0451  type IV pilus assembly PilZ  30.69 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0636  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  24.82 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1480  hypothetical protein  24.02 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  31.68 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>