14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1844 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  27.22 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  27.22 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  25.13 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1947  type IV pilus assembly PilZ  28.96 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  24.06 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  24.21 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  24.21 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  24.87 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  24.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  23.98 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  23.04 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  21.69 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  31.17 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>