16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1901 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  98.38 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  27.03 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  26.37 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  25.82 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  27.22 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  25.14 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  26.06 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  25.27 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  23.3 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  24 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  23.12 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  23.86 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  23.04 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  22.35 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>