19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2172 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  396  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  97.99 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  67.55 
 
 		 188 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  58.06 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  50.99 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  52.27 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  51.14 
 
 		 194 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  52.84 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  51.14 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  50 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  28.42 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  33.7 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  26.37 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  25.82 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  27.62 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  24.32 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  24.16 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  24.06 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  23.59 
 
 		 200 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>