31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3480 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  41.45 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  42.93 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  30.32 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  29.69 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  27.68 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  31.02 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  28.73 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  27.51 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  26.4 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  26.6 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  27.81 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  26.73 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  26.53 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  26.51 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  25.11 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  26.03 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  25.62 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  27.59 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  26.03 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  26.94 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  26.09 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  24.74 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  24.74 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  23.83 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  25.14 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  28.24 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  21.66 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  23.26 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  21.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  23.17 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>