22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5004 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 314 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  85.35 
 
 		 310 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  61.74 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  31.86 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  31.86 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  30.85 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  27.52 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  29.05 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  31.72 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  31.72 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  30.63 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  32.31 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  31.85 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  29.47 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  30.81 
 
 		 248 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  24.03 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  24.03 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  24.01 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  21.81 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0872  glycosyltransferase-like protein  22.86 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  23.61 
 
 		 225 aa  45.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 		 214 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>