20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0639 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  29.15 
 
 
315 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  29.91 
 
 
310 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  30.81 
 
 
314 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  27.7 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2510  acetolactate synthase small subunit  27.98 
 
 
223 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180225  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  28.7 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  27.57 
 
 
298 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  26.7 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  26.7 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  26.05 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  27.36 
 
 
290 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  23.45 
 
 
240 aa  62  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  30.56 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  25.86 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  24.43 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>