20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4508 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  38.83 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  37.46 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  27.03 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  30 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  30 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  26 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  26 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  27.36 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  23 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  24.01 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  26.57 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  26.57 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  20.89 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  27.27 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  24.29 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  26.54 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  25.79 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  25.79 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  22.52 
 
 		 215 aa  42.4  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>