17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5690 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  27.18 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  23.44 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  23.44 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  29.79 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  24.39 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  29.41 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  23.85 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  23.85 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  23.95 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  24.57 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  22.67 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  26.02 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  45.24 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  37.25 
 
 		 409 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>