21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4176 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 301 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  82.78 
 
 		 315 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  31.86 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  31.95 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  32.38 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  29.9 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  26.44 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  26 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  26.89 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  26.89 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2510  acetolactate synthase small subunit  28.27 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  23.49 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  25.09 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  25.34 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  22.37 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  25.08 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  22.66 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>