16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3771 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 291 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  97.59 
 
 		 291 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  74.83 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  73.54 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  73.54 
 
 		 291 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  73.97 
 
 		 292 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  31.85 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  32.53 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  31.94 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  28.79 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  28.79 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  24.75 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  25.09 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  25.09 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  24.75 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  23.28 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>