26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1142 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 321 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  63.79 
 
 		 298 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  37.46 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  32.91 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  35.2 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  31.95 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  31.95 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  35.2 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  29.05 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  27.15 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  27.85 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  28.7 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  25.87 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  25.77 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  26.2 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  24.62 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  23.84 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  23.28 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  24.06 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  22.27 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1745  type IV pilus assembly PilZ  22.37 
 
 		 215 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  21.77 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  22.42 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  23.58 
 
 		 222 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>