17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1658 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  80.89 
 
 
304 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  80.89 
 
 
291 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  80.89 
 
 
292 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  74.83 
 
 
291 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  74.06 
 
 
291 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  32.87 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  32.04 
 
 
310 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  30.63 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  25.75 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  27.34 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  27.34 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  23.02 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  25.08 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  25.08 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1401  type IV pilus assembly PilZ  25.55 
 
 
232 aa  42.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>