19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4115 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  34.33 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  35.2 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  30.69 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  27.85 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  28.05 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  28.09 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  28.09 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  25.77 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  24.62 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4362  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4005  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4245  type IV pilus assembly PilZ  30.67 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5992  type IV pilus assembly PilZ  28.98 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3771  type IV pilus assembly PilZ  29.92 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1658  hypothetical protein  28.18 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197797  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  25.32 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>