25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1957 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  25.48 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  27.13 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  26.05 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  24.16 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  24.16 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1261  hypothetical protein  25.63 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  24.15 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  23.57 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  22.26 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2510  acetolactate synthase small subunit  25.24 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  23.67 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5004  type IV pilus assembly PilZ  22.79 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646508  hitchhiker  0.0000203708 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  22.81 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4115  type IV pilus assembly PilZ  25.32 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4002  type IV pilus assembly PilZ  25.32 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0975643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 		 385 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  27.12 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  24.57 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  23.24 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  24.41 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 		 375 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  38 
 
 		 409 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>