12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2510 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2510  acetolactate synthase small subunit  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  27.98 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  25.71 
 
 		 309 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  28.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  28.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  24.12 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  28.48 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  28.48 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1643  hypothetical protein  23.72 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143249  normal  0.0274054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  21.92 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  22.87 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>