14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4246 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  25.25 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  24.39 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  23.76 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  24.51 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  24.26 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  24.74 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  27.27 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  23.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  24.07 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  24.75 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2510  acetolactate synthase small subunit  21.92 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  20.53 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000532  hypothetical protein  23.84 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.890998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>