21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0992 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  26.7 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  24.09 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  23.44 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  22.56 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3147  type IV pilus assembly PilZ  23.96 
 
 
317 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  25.68 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2510  acetolactate synthase small subunit  28.48 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180225  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4508  hypothetical protein  26.57 
 
 
290 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0134267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  27.34 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  26.55 
 
 
208 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  26.5 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  25.81 
 
 
252 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  22.08 
 
 
305 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  24.26 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  23.56 
 
 
321 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>