16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2940 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  50.45 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  39.91 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  25.73 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  28.64 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  24.12 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  25.14 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  24.67 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  23.96 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  23.24 
 
 		 309 aa  45.4  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  24.26 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  24.26 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3582  hypothetical protein  24.85 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  24.24 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  22.75 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  24.83 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>