18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1127 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 214 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  28.04 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  25.73 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  28.71 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  36.76 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  26.04 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  22.92 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  24.04 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4131  type IV pilus assembly PilZ  29 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0260  hypothetical protein  28.95 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  24.49 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  25.93 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  23.98 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1670  type IV pilus assembly PilZ  23.62 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  27.78 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  23.11 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  24.31 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  24.31 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>