13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0573 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  28.77 
 
 
236 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  28.71 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  32.18 
 
 
223 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  28.64 
 
 
222 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  24.86 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  24.04 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  20.53 
 
 
222 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2294  putative type IV pilus assembly (PilZ) protein  23.66 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  24.74 
 
 
208 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  23.04 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  27.78 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  26.81 
 
 
308 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.219768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>